阅读清单:SARS-CoV-2的起源是什么? 功能获得研究的风险是什么?

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这是一份有关SARS-CoV-2的起源,生物安全和生物战实验室的事故和泄漏以及功能获得(GOF)研究的健康风险的已知和未知的阅读清单。潜在大流行病原体的宿主范围,传播性,传染性或致病性。

该阅读清单正在进行中。 我们将对其进行更新。 请发送我们可能错过的阅读材料给Sainath Suryanarayanan,网址为 sainath@usrtk.org.

SARS-CoV-2的起源是什么?
生物安全设施中的事故,泄漏,透明性故障
生物防御和生物战网络
关于功能获得研究的辩论
关于SARS-CoV-2起源的科学论文

SARS-CoV-2的起源是什么?

诉讼中的国家科学院院士. 要阻止下一次大流行,我们需要阐明COVID-19的起源. 戴维·雷尔曼。 十一月3,2020。

原子科学家的公报。 SARS-CoV-2病毒是否来自中国实验室的蝙蝠冠状病毒研究计划? 很有可能。 米尔顿·莱滕伯格。 4年2020月XNUMX日。

华盛顿邮报。 国务院电缆警告武汉研究蝙蝠冠状病毒的安全问题. 乔希·罗金(Josh Rogin)。 14年2020月XNUMX日。

休斯顿纪事报. UTMB科学家承认在中国进行冠状病毒研究的实验室存在安全隐患。 尼克·鲍威尔(Nick Powell)。 23年2020月XNUMX日。 

华尔街日报. NIH敦促美国非营利组织获取有关武汉病毒学实验室的信息。 贝茜·麦凯。 19年2020月XNUMX日。  

“华尔街日报”。 那么病毒是从哪里来的呢? 马特·里德利(Matt Ridley)。 29年2020月XNUMX日。 

波士顿杂志. COVID-19能否从实验室逃脱? 罗恩·雅各布森(Rowan Jacobsen)。 9年2020月XNUMX日。 

自然. 最大的谜团:如何追踪冠状病毒源。 大卫·西拉诺斯基(David Cyranoski)。 5年2020月XNUMX日。

新闻周刊。 有争议的实验和武汉实验室被怀疑引发冠状病毒大流行. 弗雷德·古特尔(Fred Guterl),纳韦德·贾玛利(Naveed Jamali)和汤姆·奥康纳(Tom O'Connor)。 27年2020月XNUMX日。

“华盛顿邮报”. 国务院发布电缆,声称冠状病毒从中国实验室逃脱. 约翰·哈德森和内特·琼斯。 17年2020月XNUMX日。 

电讯报。 科学家检查Covid从实验室泄漏的可能性,作为对病毒起源进行调查的一部分. 保罗·努基15年2020月XNUMX日。  

“华尔街日报”。 在武汉地面上,中国冠状病毒起源的拖延探针迹象。 杰里米·佩奇(Jeremy Page)和娜塔莎·汗(Natasha Khan)。 12年2020月XNUMX日。 

NBC新闻. 报告称手机数据表明武汉实验室将于十月停产,但专家对此表示怀疑。 Ken Dilanian,Ruaridh Arrow,Courtney Kube,Carol E. Lee,Louise Jones和Lorand Bodo。 9年2020月XNUMX日。 

华盛顿邮报。 covid-19是如何开始的? 其最初的故事动摇. 大卫·伊格纳修斯(David Ignatius)。 2年2020月XNUMX日。

“泰晤士报”. 揭露:七年冠状病毒从矿山死亡到武汉实验室的踪迹。 George Arbuthnott,Jonathan Calvert和Philip Sherwell。 4年2020月XNUMX日。

英国广播公司. 武汉:寂静之城; 在冠状病毒开始的地方寻找答案。 约翰·萨德沃思(John Sudworth)。 2020年XNUMX月。

纽约时报, 来自大流行病起源的疾病侦探的8个问题. 威廉·J·布罗德。 8年2020月XNUMX日。

科学. 世卫组织领导的特派团可调查大流行的起源。 这是要问的关键问题。 乔恩·科恩。 10年2020月XNUMX日。

纽约时报. 世卫组织让中国负责寻找病毒源. Selam Gebrekidan, 马特·阿普佐(Matt Apuzzo), 秦my。 十一月2,2020。

“华盛顿邮报”. 冠状病毒的起源仍然是一个谜。 我们需要进行全面调查。 月14,2020。

独立. 冠状病毒:前MI6负责人称中国实验室大流行“始于事故”。 安迪·格雷戈里(Andy Gregory)。 4年2020月XNUMX日。

华尔街日报. 美国情报机构以罕见的举动确认调查是否因实验室事故而出现冠状病毒。 沃伦·斯特罗贝尔(Warren P.Strobel)和达斯汀·沃尔兹(Dustin Volz)。 30年2020月XNUMX日。

华尔街日报. 中国蝙蝠专家说她在武汉的实验室不是新冠状病毒的来源。 詹姆斯·T·阿迪21年2020月XNUMX日。

美国广播公司新闻. 对不起,阴谋论者。 研究得出COVID-19“不是实验室结构”的结论。 凯特·荷兰(Kate Holland)。 27年2020月XNUMX日。 

“经济学家”. Covid-19起源的困惑之谜即将揭晓。 可能是2,2020。 

华尔街日报. 武汉实验室理论。 编辑委员会。 6年2020月XNUMX日。 

守护者. 忽略阴谋论:科学家知道Covid-19不是在实验室中创建的。 彼得·达萨克(Peter Daszak)。 9年2020月XNUMX日。 

科学。 特朗普“欠我们道歉”。 中国科学家在COVID-19起源理论的中心发表讲话。 乔恩·科恩。 24年2020月XNUMX日。

科学。 回复科学杂志:施正立问答. 石正立15年2020月XNUMX日。

密涅瓦. 矛盾的说法使中国原始数据产生疑问. AkselFridstrøm。 10年2020月XNUMX日。 

密涅瓦. 最合乎逻辑的解释是,它来自实验室. AkselFridstrøm和Nils August Andresen。 2年2020月XNUMX日。 

“新闻周刊”. Fauci博士以美元资助了有争议的武汉实验室进行冠状病毒研究. 弗雷德·古特尔(Fred Guterl)。 28年2020月XNUMX日。

独立科学新闻. 案例证明COVID-19源自实验室。 乔纳森·拉瑟姆(Jonathan Latham)和艾莉森·威尔逊(Allison Wilson)。 5年2020月XNUMX日。

独立科学新闻. SARS-CoV-2和COVID-19大流行的拟议起源。 乔纳森·莱瑟姆(Jonathan Latham)和艾莉森·威尔逊(Allison Wilson)。 15年2020月XNUMX日。

联邦党人. 病毒学家解释了他对追踪COVID-19起源的追求。 朱利安·维哥(Julian Vigo)。 2年2020月XNUMX日。 

Sam Husseini博客. 向疾病预防控制中心提出疑问:中国唯一的BSL4在武汉是否完全是巧合? 音视频。 山姆·侯赛尼。 17年2020月XNUMX日。

GMWatch. 武汉和美国科学家对蝙蝠冠状病毒使用了无法检测到的基因工程方法。 乔纳森·马修斯和克莱尔·罗宾逊。 20年2020月XNUMX日。 

企业犯罪记者. 安德鲁·金布雷(Andrew Kimbrell)关于COVID-19的起源。 罗素·莫赫伯(Russell Mokhiber)。 11年2020月XNUMX日。

GMWatch。 COVID-19病毒是基因改造的吗? 乔纳森·马修斯(Jonathan Matthews)。 22年2020月XNUMX日。

GMWatch。 为什么实验室逃生否认主义者会讲这么大胆的谎言? 乔纳森·马修斯(Jonathan Matthews)。 17年2020月XNUMX日。 

NBC新闻. 在中国实验室内寻找冠状病毒的起源。 Janis Mackey Frayer和Denise Chow。 10年2020月XNUMX日。

拦截. 特朗普政府在热烈谴责中国冠状病毒的过程中,阻止了对该流行病起源的调查. 马拉·维斯滕达尔。 可能是19,2020。

Edizioni Cantagalli。 Cina Covid 19. La Chimera che ha cambiato il mondo (中国COVID-19:改变世界的嵌合体)。 约瑟夫·特里托。 2020年XNUMX月。 

生物安全设施中的事故,泄漏,收容失败,透明性失败

纽约客。 建立太多生物实验室的风险。 伊丽莎白屋檐。 18年2020月XNUMX日。 

原子科学家的公报。 高生物控制实验室中的人为错误:可能是大流行的威胁。 Lynn Klotz。 25年2019月XNUMX日。 

詹姆斯·马丁防扩散中心 学习. 调查暴发起源的指南:自然与实验室。 Richard Pilch,Miles Pomper,Jill Luster和Filippa Lentzos。 2020年XNUMX月。

ProPublica。 这是UNC研究人员在实验室制造的冠状病毒中发生的六起事故。 艾莉森·杨(Alison Young)和杰西卡·布雷克(Jessica Blake)。 17年2020月XNUMX日。 

加拿大广播公司. 加拿大科学家在皇家骑警要求调查前几个月将致命病毒发送到武汉实验室. 日16,2020。

弗雷德里克新闻报. 美国疾病预防控制中心(CDC)检查结果揭示了有关USAMRIID研究暂停的更多信息. 希瑟·蒙吉利奥。 23年2019月XNUMX日。 

疾病控制与预防中心(CDC)和美国农业部. 美国陆军传染病医学研究所(USAMRIID):检查结果定义的描述。 八月2019。

美国政府问责办公室。 高安全性实验室:为提高安全性而需要的全面,最新的政策和更强大的监督机制。 19年2016月16日。GAO-305-XNUMX。 

今日美国。 全国生物实验室发现10起事件。 艾莉森·杨(Alison Young)和尼克·彭岑斯塔德勒(Nick Penzenstadler)。 29年2015月XNUMX日。 

原子科学家的公报。 受威胁的大流行和实验室逃生:自我实现的预言. 马丁·弗曼斯基(Martin Furmanski)。 31年2014月XNUMX日。

军备控制与不扩散中心. 逃脱实验室和“自我实现的预言”流行病。 马丁·弗曼斯基(Martin Furmanski)。 17年2014月XNUMX日。

国家研究委员会. 高含量生物实验室全球扩展的生物安全挑战:讲习班摘要。 2012年。华盛顿特区:国家科学院出版社。 https://doi.org/10.17226/13315 

美国众议院。 能源和商业委员会。 聆听细菌,病毒和秘密:美国生物实验室的无声扩散,110th 代表大会. 十月4,2007。

美国众议院。 能源和商业委员会。 第一百一次国会听取联邦政府对高污染生物实验室的监督, 九月22,2009。

英国医学杂志。 世卫组织表示,违反安全法规可能是近期爆发非典的原因. 简·帕里(Jane Parry)。 22年2004月10.1136日。doi:328.7450.1222 / bmj.XNUMX-b

独立科学新闻。 COVID-19媒体报道忽略了实验室潜在大流行病原体意外释放的悠久历史. 山姆·侯赛尼。 5年2020月XNUMX日。

GMWatch。 COVID-19:对生物安全的警钟. 乔纳森·马修斯(Jonathan Matthews)。 24年2020月XNUMX日。 

今日美国. 疾病预防控制中心没有向国会透露与生物恐怖病原体有关的实验室事件。 艾莉森·杨(Alison Young)。 24年2016月XNUMX日。

全球时报。 发布生物安全指南以修复病毒实验室的长期管理漏洞. 刘才玉和冷书梅。 16年2020月XNUMX日。

哥伦比亚广播公司新闻. 调查:美国公司对埃博拉病毒反应不佳。 美联社。 7年2016月XNUMX日。 

GMWatch。 SARS-CoV-2的期刊审查实验室起源理论. 克莱尔·罗宾逊(Claire Robinson)。 16年2020月XNUMX日。 

生物防御和生物战网络 

沙龙。 该病毒是来自实验室吗? 也许不是,但是它暴露了生物战军备竞赛的威胁。 山姆·侯赛尼。 24年2020月XNUMX日。

Sam Husseini博客. 避免将目光从生物战中转移:大流行和自我实现的预言。 山姆·侯赛尼。 2020年XNUMX月。 

波士顿环球报。 生物武器的诱惑. Bernard Lown和Prasannan Parthasarathi。 23年2005月XNUMX日。 

蒙特利国际问题研究所。 关于生物危害的北京:有关生物武器不扩散问题的中国专家. 艾米·史密森(Amy E. Smithson),编辑。 2007年XNUMX月。詹姆斯·马丁防扩散研究中心。

致命文化:自1945年以来的生物武器。 马克·惠利斯,拉霍斯·罗萨和马尔科姆·丹多(编辑)。 哈佛大学出版社, 2006.

生物战与恐怖主义。 弗朗西斯·博伊尔。 2005年。ClarityPress,Inc.。

防止生物军备竞赛。 苏珊·赖特(编辑)。 麻省理工学院出版社 1990. 

生化危机。 肯·阿里贝克(Ken Alibek)和斯蒂芬·汉德尔曼(Stephen Handelman)。 兰登书屋:纽约,1999年。 

关于功能获得研究的辩论

国家科学院出版社。 功能获得研究的潜在风险和收益:研讨会总结. 2015. 

“福布斯”. 我们应该允许科学家制造危险的超级病毒吗? 史蒂文·萨尔茨伯格。 20年2014月XNUMX日。 

剑桥工作组. 剑桥工作组关于潜在大流行病原体(PPP)产生的共识声明。 七月14,2014。 

mBio。 潜在的大流行病原体实验的有限科学价值能否证明风险? 马克·利普西奇(Marc Lipsitch)。 14年2014月XNUMX日。doi: https://doi.org/10.1128/mBio.02008-14 

姆比奥. 高致病性H5N1流感病毒的研究:前进的方向。 安东尼·福西(Anthony S.Fauci)。 2012年3月至5月,00359(12):e10.1128-00359。 doi:12 / mBio.XNUMX-XNUMX

mBio。 跌入兔子洞:在“功能增益”辩论中,朝向词汇精确度的aTRIP。 W. Paul Duprex和Arturo Casadevall。 卷5,6 e02421-14。 12年2014月10.1128日,doi:02421 / mBio.14-XNUMX

“公共科学图书馆•医学”. 新型潜在大流行病原体实验的伦理选择。 Marc Lipsitch和Alison Galvani。 2014(11):e5。 doi:1001646 / journal.pmed.10.1371  

关于SARS-CoV-2起源的科学论文

“柳叶刀”. 中国武汉市2019年新型冠状病毒感染患者的临床特征。 黄朝林等。 30年2020月395日。第497卷:506-XNUMX。 

的性质。 与可能是蝙蝠起源的新冠状病毒相关的肺炎暴发. 周鹏,杨星洛,王宪光,胡本和……以及石正立。 2020(579):7798-270。 doi:273 / s10.1038-41586-020-2012

自然医学. SARS-CoV-2的近端起源. Kristian G.Andersen,Andrew Rambaut,W.Ian Lipkin,Edward C.Holmes,Robert F.Garry。 2020年26月。第450卷,第455-XNUMX页。 

医学病毒学杂志. 有关SARS-CoV-2近端起源的问题。 穆拉特·塞兰(Murat Seyran),达米亚诺·皮佐(Damiano Pizzol),巴黎阿迪(Parade Adadi)以及亚当·布鲁夫斯基(Adam M. Brufsky)。 3年2020月XNUMX日。 https://doi.org/10.1002/jmv.26478 

生物论文集。 SARS-CoV-2可能通过动物宿主或细胞培养物的连续传代而产生吗? 卡尔·西罗特金(Karl Sirotkin)和丹·西罗特金(Dan Sirotkin)。 12年2020月XNUMX日。 https://doi.org/10.1002/bies.202000091

公共卫生前沿。 墨江矿工的致命性肺炎病例(2012年)和矿井可能为SARS-CoV-2的起源提供重要线索. Monali Rahalkar和Rahul Bahulikar。 17年2020月10.3389日。doi:2020.581569 / fpubh.XNUMX

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Zenodo. 2019年冠状病毒大流行在哪里开始以及如何传播? 中国武汉的解放军医院和武汉地铁二号线令人信服。 史蒂文·卡尔码头。 28年2020月XNUMX日。 10.5281 / zenodo.4119262

中等. 实验室制造的? 从功能获得研究的角度看SARS-CoV-2家谱。 尤里·迪金(Yuri Deigin)。 22年2020月XNUMX日。 

密涅瓦. 证明这不是自然进化的病毒的证据:SARS-CoV-2穗突的重建历史病因。 BirgerSørensen,Angus Dalgleish和Andres Susrud。 1年2020月XNUMX日。

研究之门. 正在考虑将SARS-CoV-2的基因操纵起源视为必须加以审查的阴谋论吗? Rossana Segreto和Yuri Deigin。 2020年10.13140月。DOI:2.2.31358.13129 / RG.1 / XNUMX

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预印本。 用于RaTG13基因组序列NGS分析的粪便拭子样品的异常性质对RaTG13序列的正确性提出了疑问. Monali Rahalkar和Rahul Bahulikar。 11年2020月10.20944日。doi:202008.0205 / preprints1.vXNUMX 

OSF预印本. COVID-19,SARS和蝙蝠冠状病毒基因组意外的外源RNA序列。 Jean-Claude Perez和Luc Montagnier。 25年2020月10.31219日。doi:9 / osf.io / d5eXNUMXg 

Zenodo. HIV人为操纵的冠状病毒基因组进化趋势。 Jean-Claude Perez和Luc Montagnier。 2年2020月XNUMX日。 

新兴微生物与感染. HIV-1对2019-nCoV基因组没有贡献. 肖川,李晓军,刘树英,桑永明,高守江,高峰。 2020. 9(1):378-381。 doi:10.1080 / 22221751.2020.1727299

arXiv. 在计算机上比较刺突蛋白-ACE2跨物种的亲和力; 对SARS-CoV-2病毒可能起源的重要性。 Sakshi Piplani,Puneet Kumar Singh,David A.Winkler,Nikolai Petrovsky。 13年2020月XNUMX日。 

自然. 鉴定马来亚穿山甲中与SARS-CoV-2相关的冠状病毒。 Tommy Tsan-Yuk Lam,Nana Jia,张亚伟,Marcus Ho-Hin Shum,Jia-Fu Jiang,朱华晨,Tong-Gang Tong,Shi Yong-xia Shi,倪学兵,廖云诗,李文娟,姜宝贵,魏伟,袁婷婷,郑奎,崔晓明,李杰,裴光谦,辛强,张耀文,李连峰,方芳孙芳,秦思琴,黄继成,梁百里,爱德华·霍姆斯,胡延龄,关冠和曹武春。 26年2020月XNUMX日。 https://doi.org/10.1038/s41586-020-2169-0

PLoS病原体. 穿山甲是2019年新型冠状病毒(SARS-CoV-2)的中间宿主吗? 刘平,姜静哲,万秀峰,闫华,李林苗,周嘉宾,王小虎,侯芳辉,陈静,邹杰建,陈金平。 14年2020月XNUMX日。doi: https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1008421

自然. 从马来亚穿山甲中分离出SARS-CoV-2相关冠状病毒。 肖康鹏,翟均琼,冯耀宇,牛牛,张旭,邹杰建,李娜,郭亚琼,李小兵,沉雪娟,张志鹏,舒凡凡,黄万怡,李丽,张子顶,瑞爱陈,吴亚江,彭世明,黄绵,谢伟军,蔡琴慧,侯方辉,吴晨,肖丽华,佘永义。 7年2020月XNUMX日。 https://doi.org/10.1038/s41586-020-2313-x

当代生物学. SARS-CoV-2的穿山甲可能与COVID-19爆发有关。 张涛,吴群夫,张志刚。 19年2020月XNUMX日。doi: https://doi.org/10.1016/j.cub.2020.03.022

bioRxiv. 单一来源的穿山甲CoV,其Spike RBD与SARS-CoV-2几乎相同。 于家佳(Alina Chan)和成喜湛(Shing Hei Zhan)。 23年2020月XNUMX日。 https://doi.org/10.1101/2020.07.07.184374

感染,遗传和进化。 COVID-19:是时候将穿山甲从SARS-CoV-2传播给人类。 罗杰·弗鲁托斯(Roger Frutos),乔迪·塞拉·科博(Jordi Serra-Cobo),陈天牧和克里斯蒂安·德沃克斯(Christian A. 第84卷,2020年104493月,XNUMX。 https://doi.org/10.1016/j.meegid.2020.104493

bioRxiv。 没有证据表明pan大穿山甲(Manis javanica)中的冠状病毒或其他潜在的人畜共患病毒通过马来西亚进入野生生物贸易. 吉米·李,汤姆·休斯,李美镐,休姆·菲尔,杰弗琳·贾普宁·罗维·瑞安,弗兰基·托马斯·西塔姆,西芙露·萨蓬奎,森特希尔维尔·凯瑟琳·内森,戴安娜·拉米雷斯,Subbiah Vijay Kumar,海伦·拉辛邦,乔纳森·H·爱泼斯坦,彼得·达扎克。 19年2020月XNUMX日。 https://doi.org/10.1101/2020.06.19.158717

病毒学档案. A 回文 RNA序列是SARS-CoV-2中复制选择重组的常见断裂点。 威廉·R·加拉赫。 31年2020月XNUMX日。

细胞。 SARS-CoV-2起源和出现的基因组观点。 张永珍,爱德华·霍姆斯。 2020年181月2(223):227-10.1016。 doi:2020.03.035 / j.cell.XNUMX。

诉讼中的国家科学院院士. 过度发炎患者中偏斜TCR谱支持的SARS-CoV-2刺突独特插入物的超抗原特性。 Mary Hongying Cheng,She Zhang,Rebecca A.Porritt,Magali Noval Rivas,Lisa Paschold,Edith Willscher,Mascha Binder,Moshe Arditi和Ivet Bahar。 28年2020月XNUMX日。 https://doi.org/10.1073/pnas.2010722117

当前生物学 与SARS-CoV-2密切相关的新型蝙蝠冠状病毒在刺突蛋白的S1 / S2裂解位点包含自然插入. 周虹,陈星,胡涛,李娟,宋浩,刘彦然,王培涵,刘迪,杨静,爱德华·C·福尔摩斯,爱丽丝·C·休斯,毕玉海和史伟峰。 8年2020月30日。2196:2203-XNUMX。 土井: https://doi.org/10.1016/j.cub.2020.05.023

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bioRxiv. SARS-CoV-2穗蛋白的弗林蛋白酶切割位点是气道细胞复制增强的关键决定因素。 汤玛斯·孔雀(Thomas Peacock),丹尼尔·H·戈德希尔(Daniel H. Goldhill),周杰...,以及温迪·巴克莱(Wendy S. 30年2020月XNUMX日。 https://doi.org/10.1101/2020.09.30.318311 

Zenodo. SARS-CoV-2基因组的异常特征表明实验室进行了复杂的修饰,而不是自然进化和描绘了其可能的合成途径。 严丽萌,舒康,关杰和胡善昌。 14年2020月10.5281日。doi:4028829 / zenodo.XNUMX  

约翰霍普金斯大学健康安全中心. 作为回应:Yan等人对SARS-CoV-2的起源进行预印本检查。 Kelsey Lane Warmbrod,Rachel M.West,Nancy D.Connell和Gigi Kwik Gronvall。 21年2020月XNUMX日。

Zenodo。 2年期间SARS-CoV-2019的拟议溢出效应审查中国云南省墨江市一个矿井的样品。 匿名。 14年2020月10.5281日。doi:4029544 / zenodo.XNUMX