Değişen veri kümeleri, koronavirüs kökenlerine ilişkin temel çalışmaların güvenilirliği hakkında daha fazla soru ortaya çıkarıyor

Print E-posta adresi paylaş Twitter

Koronavirüs kökenleri üzerine dört temel çalışmayla ilişkili genomik veri kümelerinde yapılan revizyonlar, hipotez için temel destek sağlayan bu çalışmaların güvenilirliği hakkında daha fazla soru ekliyor. SARS-CoV-2'nin vahşi yaşamdan kaynaklandığını. Çalışmalar, Peng Zhou ve diğerleri., Hong Zhou ve diğerleri., Lam vd., ve Xiao vd., at nalı yarasalarında ve Malaya pangolinlerinde SARS-CoV-2 ile ilgili koronavirüsleri keşfetti.

Çalışmaların yazarları, adı verilen DNA dizisi verilerini dizi okurUlusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi'nde (NCBI) yarasa ve pangolin koronavirüs genomlarını bir araya getirmek için kullandıkları sıralı okuma arşivi (SRA). NCBI, yüksek verimli sıralama teknolojilerine dayalı olarak genomik analizlerin bağımsız olarak doğrulanmasına yardımcı olmak için genel veritabanını oluşturdu.

ABD Bilme Hakkı, kamuya açık kayıtlardan alınan belgeler, düzeltmeleri göster bu çalışmaların SRA verilerine yayınlandıktan aylar sonra. Bu revizyonlar tuhaftır çünkü yayınlandıktan sonra ve herhangi bir gerekçe, açıklama veya doğrulama olmaksızın meydana gelmiştir.

Örneğin, Peng Zhou vd. ve Lam vd. SRA verilerini aynı iki tarihte güncelledi. Belgeler verilerini neden değiştirdiklerini açıklamıyor, sadece bazı değişikliklerin yapıldığını. Xiao vd. çok sayıda değişiklik yaptı 10 Mart'ta iki veri kümesinin silinmesi, 19 Haziran'da yeni bir veri kümesinin eklenmesi, ilk olarak 8 Ekim'de yayımlanan verilerin 30 Kasım'da değiştirilmesi ve 13 Kasım'da başka bir veri değişikliği de dahil olmak üzere SRA verilerine - iki gün sonra Doğa bir Editörün "kaygı notu" ekledi çalışma hakkında. Hong Zhou vd. henüz bağımsız doğrulamayı etkinleştirecek tam SRA veri kümesini paylaşmadı. Dergiler beğenirken Doğa yazarların tüm verileri yapmasını gerektir "hemen uygun"Yayın anında SRA verileri yayınlanabilir sonra yayın; ancak bu tür değişikliklerin yayınlandıktan aylar sonra yapılması alışılmadık bir durumdur.

SRA verilerindeki bu olağandışı değişiklikler, dört çalışmayı ve bunlarla ilişkili veri kümelerini otomatik olarak güvenilmez hale getirmez. Ancak, SRA verilerindeki gecikmeler, boşluklar ve değişiklikler engellenmiş bağımsız montaj ve doğrulama yayınlanmış genom dizilerinin sorular ve endişeleri hakkında the geçerlik dört çalışmadan, örneğin:

  1. SRA verilerinde yapılan tam yayın sonrası revizyonlar nelerdi? Neden yapıldılar? İlişkili genomik analizleri ve sonuçları nasıl etkilediler?
  2. Bu SRA revizyonları bağımsız olarak doğrulandı mı? Öyleyse nasıl? NCBI'nin tek doğrulaması "organizma adı" gibi temel bilgilerin ötesinde bir SRA BioProject yayınlamak için kriter, bir kopya olamayacağıdır.

Daha fazla bilgi için: 

The Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi (NCBI) belgeler burada bulunabilir: NCBI e-postaları (63 sayfa)

ABD Bilme Hakkı, biyolojik tehlikeler araştırmamız için herkese açık kayıt taleplerimizden belgeler yayınlamaktır. Görmek: SARS-CoV-2'nin kökenleri, işlev kazanımı araştırmasının tehlikeleri ve biyogüvenlik laboratuvarları hakkındaki FOI belgeleri.

Arka plan sayfası ABD Bilme Hakkı'nın SARS-CoV-2'nin kökenlerine ilişkin araştırması.