Seti za data zilizobadilishwa huinua maswali zaidi juu ya kuaminika kwa masomo muhimu juu ya asili ya coronavirus

magazeti Barua pepe Kushiriki Tweet

Marekebisho ya hifadhidata za genomic zinazohusiana na masomo manne muhimu juu ya asili ya coronavirus huongeza maswali zaidi juu ya uaminifu wa masomo haya, ambayo hutoa msaada wa msingi kwa nadharia hiyo. kwamba SARS-CoV-2 ilitokana na wanyamapori. Masomo, Peng Zhou et al., Hong Zhou et al., Lam et al., na Xiao et al., aligundua coronaviruses zinazohusiana na SARS-CoV-2 katika popo za farasi na pangolini za Malaysia.

Waandishi wa masomo waliweka data ya mlolongo wa DNA inayoitwa mlolongo unasoma, ambayo walitumia kukusanya genome za bat- na pangolin-coronavirus, katika Kituo cha Kitaifa cha Habari za Bioteknolojia (NCBI) mlolongo soma kumbukumbu (SRA). NCBI ilianzisha hifadhidata ya umma kusaidia uthibitisho huru wa uchambuzi wa genomic kulingana na teknolojia za upitishaji wa hali ya juu.

Haki ya Kujua ya Amerika ilipata hati na rekodi ya umma ombi kwamba onyesha marekebisho kwa data hizi za SRA miezi kadhaa baada ya kuchapishwa. Marekebisho haya ni ya kushangaza kwa sababu yalitokea baada ya kuchapishwa, na bila busara yoyote, maelezo au uthibitishaji.

Kwa mfano, Peng Zhou et al. na Lam et al. ilisasisha data yao ya SRA kwa tarehe mbili zile zile. Nyaraka hazielezei kwanini walibadilisha data zao, isipokuwa tu kwamba mabadiliko mengine yalifanywa. Xiao et al. alifanya mabadiliko kadhaa kwa data zao za SRA, pamoja na kufutwa kwa hifadhidata mbili mnamo Machi 10, kuongezewa daftari mpya mnamo Juni 19, kubadilishwa kwa data ya Novemba 8 ya kwanza iliyotolewa mnamo Oktoba 30, na mabadiliko zaidi ya data mnamo Novemba 13 - siku mbili baada Nature Aliongeza "maelezo ya wasiwasi" ya Mhariri kuhusu utafiti. Hong Zhou et al. bado sijashiriki daftari kamili ya SRA ambayo itawezesha uthibitishaji huru. Wakati majarida yanapenda Nature inahitaji waandishi watengeneze data zote "inapatikana mara moja”Wakati wa kuchapishwa, data ya SRA inaweza kutolewa baada ya uchapishaji; lakini sio kawaida kufanya mabadiliko kama hayo miezi baada ya kuchapishwa.

Mabadiliko haya ya kawaida ya data ya SRA hayafanyi otomatiki masomo hayo manne na hifadhidata za data zinazohusiana kuwa zisizoaminika. Walakini, ucheleweshaji, mapungufu na mabadiliko katika data ya SRA kukwamisha mkutano huru na uhakiki ya utaratibu uliochapishwa wa genome, na ongeza kwa maswali na wasiwasi kuhusu the uhalali ya masomo manne, kama vile:

  1. Je! Ni marekebisho gani haswa baada ya kuchapishwa kwa data ya SRA? Kwa nini zilitengenezwa? Je! Ziliathirije uchambuzi na matokeo yanayohusiana ya genomic?
  2. Je! Marekebisho haya ya SRA yalithibitishwa kwa uhuru? Ikiwa ni hivyo, vipi? The Uthibitishaji pekee wa NCBI kigezo cha kuchapisha SRA BioProject- zaidi ya habari ya msingi kama vile "jina la kiumbe" - ni kwamba haiwezi kuwa dabali.

Kwa habari zaidi: 

The Kituo cha Taifa cha Habari za Biotechnology (NCBI) hati zinaweza kupatikana hapa: Barua pepe za NCBI (63 kurasa)

Haki ya Kujua ya Amerika inachapisha hati kutoka kwa maombi yetu ya rekodi za umma kwa uchunguzi wetu wa biohazards. Tazama: Nyaraka za FOI juu ya asili ya SARS-CoV-2, hatari za utafiti wa faida-ya-kazi na maabara ya usalama.

Ukurasa wa nyuma juu ya uchunguzi wa Haki ya Kujua ya Amerika juu ya asili ya SARS-CoV-2.