مجموعه داده های تغییر یافته س questionsالات بیشتری در مورد قابلیت اطمینان مطالعات کلیدی در مورد ریشه ویروس کرونا ایجاد می کند

چاپ پست الکترونیک (ایمیل) اشتراک گذاری توییتر

تجدید نظر در مجموعه داده های ژنومی مرتبط با چهار مطالعه کلیدی در مورد ریشه ویروس کرونا ، س furtherالات بیشتری را در مورد قابلیت اطمینان این مطالعات اضافه می کند ، که پشتیبانی بنیادی از فرضیه را فراهم می کند که SARS-CoV-2 از حیات وحش نشات گرفته است. مطالعات ، پنگ ژو و دیگران., هونگ ژو و دیگران., لام و دیگرانو شیائو و همکاران، ویروس های کرونا ویروس مربوط به SARS-CoV-2 را در خفاش های نعل اسب و پانگولین های مالایی کشف کرد.

نویسندگان این مطالعه داده های توالی DNA را به نام سپرده گذاری کردند دنباله می خواند، که آنها برای جمع آوری ژنوم ویروس خفاش و پانگولین-کرونا ویروس استفاده کردند ، در مرکز ملی اطلاعات بیوتکنولوژی (NCBI) دنباله بایگانی را بخوانید (SRA) NCBI پایگاه داده عمومی را برای کمک به تأیید مستقل تجزیه و تحلیل ژنومی مبتنی بر فناوری های توالی یابی با توان بالا ایجاد کرد.

حق ایالات متحده برای دانستن اسناد به دست آمده از سوابق عمومی این است که تجدید نظر را نشان می دهد به داده های SRA این مطالعات ماه ها پس از انتشار آنها رسیده است. این اصلاحات عجیب و غریب است زیرا پس از انتشار و بدون هیچ دلیل منطقی ، توضیحی یا تأییدی رخ داده است.

به عنوان مثال، پنگ ژو و دیگران و لام و دیگران داده های SRA خود را در همان دو تاریخ به روز کرد. این اسناد توضیح نمی دهند که چرا آنها داده های خود را تغییر داده اند ، فقط این که برخی از تغییرات ایجاد شده است. شیائو و همکاران تغییرات بیشماری ایجاد کرد به داده های SRA آنها ، از جمله حذف دو مجموعه داده در 10 مارس ، افزودن مجموعه داده جدید در 19 ژوئن ، جایگزینی داده های 8 نوامبر برای اولین بار در 30 اکتبر و تغییر داده های بیشتر در 13 نوامبر - دو روز بعد طبیعت "یادداشت نگرانی" یک سردبیر را اضافه کرد در مورد مطالعه هونگ ژو و دیگران هنوز مجموعه داده SRA کامل را که تأیید مستقل را فعال می کند ، به اشتراک نگذاشته اند. در حالی که ژورنال ها دوست دارند طبیعت نویسندگان را ملزم به ساختن تمام داده ها "به سرعت در دسترس است"در زمان انتشار ، داده های SRA می توانند منتشر شوند بعد از انتشار؛ اما انجام چنین تغییراتی ماهها پس از انتشار غیرمعمول است.

این تغییرات غیرمعمول در داده های SRA به طور خودکار چهار مطالعه و مجموعه داده های مرتبط با آنها را غیر قابل اعتماد نمی کند. با این حال ، تاخیرها ، شکاف ها و تغییرات در داده های SRA وجود دارد مانع مونتاژ و راستی آزمایی می شود از توالی ژنوم منتشر شده ، و اضافه کنید به پرسش و نگرانی ها در باره la اعتبار از چهار مطالعه ، مانند:

  1. اصلاحات دقیق پس از انتشار داده های SRA چه بود؟ چرا ساخته شده اند؟ آنها چگونه بر تجزیه و تحلیل و نتایج ژنومی مرتبط تأثیر گذاشتند؟
  2. آیا این بازنگری های SRA به طور مستقل تأیید شده است؟ اگر چنین است، چگونه؟ اعتبار سنجی NCBI معیار انتشار یک SRA BioProject - فراتر از اطلاعات اساسی مانند "نام ارگانیسم" - این است که نمی تواند کپی باشد.

برای کسب اطلاعات بیشتر: 

La مرکز ملی اطلاعات بیوتکنولوژی (NCBI) اسناد را می توان در اینجا یافت: ایمیل های NCBI (صفحات 63)

حق دانستن ایالات متحده ارسال اسنادی از درخواست سوابق عمومی ما برای تحقیق در مورد خطرهای زیستی است. دیدن: اسناد FOI در مورد منشأ SARS-CoV-2 ، خطرات تحقیقات سودمند و آزمایشگاه های ایمنی زیستی.

صفحه پس زمینه در مورد حق دانستن ایالات متحده درباره تحقیق در مورد ریشه های SARS-CoV-2.

هیچ بررسی نظیری برای افزودن به مطالعه برجسته ویروس کرونا وجود ندارد؟

چاپ پست الکترونیک (ایمیل) اشتراک گذاری توییتر

ژورنال طبیعت قابلیت اطمینان ادعاهای مهم مطرح شده در 17 نوامبر را ارزیابی نکرد ضمیمه به مطالعه در خاستگاه خفاش از ویروس کرونا ویروس SARS-CoV-2 ، مکاتبه با طبیعت کارکنان پیشنهاد می کنند.

در تاریخ 3 فوریه سال 2020 ، دانشمندان موسسه ویروس شناسی ووهان گزارش دادند که نزدیکترین خویشاوند شناخته شده SARS-CoV-2 ، ویروس کرونا خفاش به نام RaTG13 را کشف کردند. RaTG13 مرکزی شده است به این فرضیه که SARS-CoV-2 در حیات وحش نشات گرفته است.

آدرس های پیوست بی پاسخ پرسش در مورد منشأ RaTG13. نویسندگان ، ژو و همکاران ، روشن کردند که آنها RaTG13 را در سال 2012-2013 "در یک مین مین رها شده در شهرستان موجیانگ ، استان یوننان" یافتند ، جایی که شش معدنچی رنج بردند سندرم دیسترس تنفسی حاد پس از قرار گرفتن در معرض مدفوع خفاشو سه نفر درگذشتند. تحقیقات در مورد علائم معدنچیان بیمار می تواند سرنخ های مهمی را ارائه دهد در مورد منشأ SARS-CoV-2. ژو و همکاران گزارش كردند كه هيچ گونه كروناويروس مرتبط با SARS در نمونه هاي سرمي ذخيره كنندگان معدن بيمار وجود ندارد ، اما آنها ادعاهاي خود را با داده ها و روش هاي آزمايش و آزمايش هاي تجربي خود تاييد نمي كنند.

عدم وجود داده های کلیدی در ضمیمه س furtherالات بیشتری مطرح کرد در مورد قابلیت اطمینان ژو و همکاران مطالعه. در تاریخ 27 نوامبر ، حق دانستن ایالات متحده پرسید طبیعت پرسش در مورد ادعاهای ضمیمه ، و درخواست که طبیعت همه داده های پشتیبانی را که ژو و همکاران منتشر می کنند منتشر کنید. ممکن است فراهم کرده باشد.

در دسامبر 2 طبیعت بکس والتون رئیس ارتباطات پاسخ داد: که ژو و همکاران اصلی مطالعه "دقیق اما نامشخص" بود ، و اینکه ضمیمه مناسب بود سکوی پس از انتشار برای روشن شدن وی افزود: "با توجه به سوالات شما ، ما شما را راهنمایی می كنیم كه برای پاسخ به نویسندگان مقاله مراجعه كنید این س questionsالات مربوط به تحقیقاتی نیست که ما منتشر کرده ایم اما در مورد سایر تحقیقات انجام شده توسط نویسندگان ، که ما نمی توانیم درباره آنها اظهار نظر کنیم "(تأکید ماست). از آنجا که س questionsالات ما مربوط به تحقیق توصیف شده در پیوست است ، طبیعت اظهارات نماینده نشان می دهد که ضمیمه ژو و همکاران به عنوان تحقیق ارزیابی نشده است.

ما پرسیدیم یک سوال پیگیری در تاریخ 2 دسامبر: "آیا این ضمیمه تحت هر گونه بررسی یا بررسی سرمقاله توسط همکاران قرار گرفت طبیعت؟ " خانم والتون پاسخ مستقیمی نداد ؛ او پاسخ داد:: "به طور کلی ، ویراستاران ما نظرات یا نگرانی هایی را که در وهله اول با ما مطرح می شود ، با مشورت با نویسندگان ، و در صورت لزوم در نظر گرفتن نظر از همتایان همکار و سایر کارشناسان خارجی ارزیابی می کنند. سیاست محرمانه بودن ما بدان معنی است که نمی توانیم در مورد رسیدگی خاص به پرونده های فردی اظهار نظر کنیم. "

پس از طبیعت ضمیمه را الف می داند پس ازبه روزرسانی انتشار، و چنین ضمیمه های انتشار پس از انتشار را به همان استانداردهای بررسی نظیر انتشارات اصلی نمی دهد ، به نظر می رسد که ژو و همکاران ضمیمه مورد بررسی همتایان قرار نگرفت.

نویسندگان Zhengli Shi و Peng Zhou پاسخی ندادند سوالات ما در مورد خود طبیعت ضمیمه